忍者联合军五个联队的番号，也已经配置完毕。

首领是火影、风影、雷影、土影、水影，加上铁之国的首领三船，一共六个人。

最高统帅是四代雷影；

五代火影纲手担任总参谋；

木叶上忍奈良鹿久、云隐上忍麻布依担任参谋；

忍者联合军的总队长是五代风影我爱罗。

联军分为五个联队。

第一部 队：中距离战斗联队，联队长是云隐上忍达鲁伊；

第二部 队：近战联队，联队长是岩隐上忍黄土；

第三部 队：近中距离战斗联队，联队长是木叶上忍旗木卡卡西；

第四部 队：远距离战斗联队，也是人数最多的联队，联队长是我爱罗，但指挥由代理联队长奈良鹿丸负责；

第五部 队：特别战斗联队，联队长是铁之国武士首领三船。

大致上就是按照忍者们的战斗方式划分的。

除此之外还有感知部队、情报部队等，负责感应敌人的方位、接受和传递情报等工作。