南窜缅甸的孙可望，兵锋继续向各地发动扩张和劫掠性质的战争。他的重点打击目标是缅甸本地的佛寺僧侣势力，对于拥有武装力量的缅甸封建主们，则采取了百般拉拢的措施。

孙可望的分化打击，对后西明在缅甸迅速站稳脚跟起到了很大作用。他日夜习读从北方传来的种种顺朝文书法令，学习李来亨的布置改革，并从中拣选出可供后西明政权使用的策略。

孙可望深知后西明朝廷身处海外异邦，面临的是举国皆敌的情势。所以明军除了打着天主教旗号，对所遇佛寺皆焚掠洗劫以外，对于一般民众及封建主豪强武装，都采取了井水不犯河水的态度。

明军保持着严格的纪律，绝不劫掠一般百姓。

由于后西明从云南撤离的时候，是井井有条做好了充分的转移准备。所以孙可望得以带走了他积蓄在云南的云、贵、川三省公私府库积蓄，这也使得缅甸的后西明政权，在财政上状态十分宽裕。

不至于因为饷粮问题，而同本地百姓及封建主势力撕破脸皮。

只是为了安置后西明的老营家眷俘虏，还有酬谢配合明军军事行动的本地华商势力，孙可望在毁灭大批佛寺的同时，也将寺社占据的土地均分给了老营家眷、缅甸华人及本土贫民，借此获得了第一批本土支持者。

从佛寺中缴获的大批金银财宝，除了拿给葡萄牙冒险家们，用于向西方殖民者采购燧发枪和新式红夷炮外，便是用来贿买缅甸封建主，使其不至于同明军作对添乱。

孙可望大约花了四个月的时间，初步完成了这些安定缅甸各地的措施。虽然忠于王室的封建主势力叛乱规模依旧很大，但明军保持有绝对的武力优势，孙可望对此一一进行了残酷的弹压，并继续实行其没收寺社财产的严酷措施，以求通过金银赏赐贿买本地封建主们的效忠。

只有在明军彻底放弃云南以后，一部分缅甸封建主得知这一重大消息后，即遣使同顺朝联系，一面请求大顺出兵入缅恢复王室，一面在缅甸国内大肆宣扬明军在云南大败的消息，酿成了一次规模最为浩大的反抗运动。

但是由于孙可望从云南撤出完全在计划之中，明军除了艾能奇一部有意被孙可望抛弃，以实现他个人在后西明政权内部的独霸地位以外，整体的主要战力，几乎全数都完整撤到了缅甸，没有遭到多大损失。

缅甸本土的反抗势力，对后西明朝廷虚弱不堪的流言深信不疑。他们误以为孙可望的运气已经到头，当即便在顺朝未作出反应以前，便集结了大量兵马，以五万兵力号称二十万大军反叛，掀起了天法三年时的上缅甸全境大起义。

经过约一年的经营以后，孙可望已经将后西明朝廷的老营家眷三十万人迁至缅甸，转移到上缅甸的明军战兵数量则有七万之众。

七万战兵，要抗衡大顺军殊为困难。