天主教的日益庞大使得德川家康坐立难安，他想到不久前佛教一向宗领导长达11年的农民起义，深恐丰臣氏遗族及反德川势力利用天主教徒的组织力量发动暴乱，于是终于下定决心采取强力措施来扑灭天主教。

就在今年2月，德川幕府正式发出禁教令，以幕府直辖领地的静冈、江户、京都、长崎为对象，三个月后又下令全国禁教。

幕府的《教渝书》称：“日本，神国、佛国也。基督教徒党传邪法，谋政变以夺国，违法令，谤神佛，礼拜罪人，祟倍有加，应予严禁。”

禁教令一下，幕府军队便在京都、伏见、大扳等地破坏教堂，逮捕教民，强迫改宗。幕府名下各地诸侯对教士和教徒也开始全面镇压。明石地方有名的丰臣派天主教诸侯高山右近等148名教徒拒绝改宗，被判处流放到马尼拉。

天主教方面肯定不能坐在那里等死，他们采取的措施是发动信徒参加丰臣遗氏一方，不断掀起倒幕运动。

颜思齐做为一直以来的日本民间倒幕英雄，便是在这个时候接到了日本耶稣会的邀请，双方约定一同起兵推翻幕府。

只不过，推翻幕府是双方共同的目标和心愿，但目的却又不同。日本耶稣会的主体是日本的诸侯，最大的支持力量是丰臣遗氏，因而他们志在推翻德川幕府，重新建立丰臣幕府。而颜思齐等汉人力量则决心趁这大好良机，在日本一举建立汉人政权，然后向大明朝廷臣属，以获得大明的支持。

在日本建立汉人政权，这听起来是十分荒唐和不可想象的事。但这绝不是颜思齐等人异想天开，也绝不是他们致力于此，而是有很多日本人也想这么干。

因为，当下日本的主流思想认为日本乃是先秦遗民，华夏支脉，日本人民和中国的汉人是同种同文，甚至一些人认为和族就是汉族，所以在日本建立汉人政权并不被学术思想界排斥，甚至还拥护。

日本国内有很多“知识分子”一生最大的梦想就是能来大明接受一次儒家典藏的学习，这些人可以统称为“精明分子”。

颜思齐的部下当中也有很多天主教徒，包括日本真正的海霸王甲必丹李旦手下也有相当数量天主教徒存在，之所以如此便是因为掌控海上航线的他们难以避免的要和西方势力打交道。

陈衷纪就是虔诚的天主教徒，魏公公既做出武装干涉日本倒幕运动，则势必要给颜思齐以及日本的倒幕力量以精神和行动支持。